המרכז לשימור המגילות על שם משפחת לונדר
במשך כ-2000 שנה השתמרו המגילות בתנאים יציבים במערות מדבר יהודה. עם הוצאתן מהמערות ובמרוצת השנים שחלפו מאז, נגרם למגילות נזק רב, בעיקר מחוסר ידע. בשנת 1991 הקימה רשות העתיקות מעבדה ייחודית לשימור המגילות. מאז ועד היום, מטפלת רשות העתיקות בסיוע טובי המומחים בעולם לשימור כתבי יד, באלפי קטעים של המגילות באמצעים המתקדמים ביותר הקיימים היום.
המרכז לתכשיטים עתיקים וממצא קטן על שם משפחת בנדט – לואיס
המרכז אוצר בתוכו עשרות אלפי ממצאים המקוטלגים ומאוחסנים בשיטה טיפולוגית – כרונולוגית. הממצאים משקפים היבטים שונים בתרבות החומרית של ארץ-ישראל: תכשיטים ותכשיטנות; חותמות וטביעות חותם מלכותיות ופרטיות, מידות ומשקולות המשקפים ענייני שררה שלטון ומנהל; צלמיות, דגמים, כלים דמויי בעלי-חיים ומזבחות המשקפים היבטים מחיי הפולחן; משקולות פלך, משקולות נול, גלגלי תנופה, לוחיות שחיקה, לוחות ואבני משחק המשקפים היבטים שעניינם תעשיות ומלאכות ותרבות הפנאי.
המרכז לשימור כלי חרס על-שם חיים ויהודית קושיצקי
המעבדות מטפלות בכלי חרס שמקורם בחפירות ארכיאולוגיות. הטיפול השימורי כולל פריסה של השברים, בנייה מחדש של הכלים (’רפאוּת‘) והשלמת הקטעים החסרים בגבס במגוון צבעים, המובחנים כתוספת מודרנית. כל כלי מטופל בהתאם למצבו. כלי חרס פריכים, צבועים, או נושאי כתובות ו/או עיטורים מיוחדים, מטופלים בשיטות שימור מורכבות יותר. העבודה מלווה בתיעוד דיגיטלי ובמחקרים טכנולוגיים.
המרכז לשימור חפצי מתכת
המעבדה מטפלת בחפצי מתכת שמקורם בחפירות ארכיאולוגיות. אלה עשויים ממגוון רחב של חומרים: ברונזה, ברזל, נחושת, עופרת, כסף וזהב. חפצים אלה עברו, בדרך כלל, תהליכי בלייה ולעתים נגרם להם נזק רב בשל רגישותם ללחות ולמלחים. הטיפול כולל הסרה של שכבת הבלייה (קורוזיה) באמצעים מכניים או כימיים, ציפוי מגן בפולימר, הדבקת כלים שנשברו ותיעוד דיגיטלי. בנוסף, נערכים מחקרים משותפים למשמרים ולארכיאולוגיים בהיבטים של הנדסת חומרים וטכנולוגיה.
המרכז לשימור זכוכית על-שם שאול פוקס
המעבדה מטפלת בכל חפצי הזכוכית שנמצאו בחפירות ארכיאולוגיות. אופיים השביר והעדין מצריך ניקוי יבש וטיפול פרטני הולם, בהתאם למצב השתמרותם. שברי החפצים מודבקים באמצעות דבקים מודרניים וייעודיים. לעתים יש צורך בהשלמת חלקים חסרים, דבר שנעשה באמצעות חומרי שימור מתאימים.
הטיפול מלווה בתיעוד דיגיטלי, ובסופו הממצאים מאוחסנים באריזת מגן מתאימה. לעתים נדרש מחקר משותף בין הארכיאולוגים לבין המשמרים בנושאי טכנולוגיה ושימור.
המרכז לשימור ממצאים אורגניים
המעבדה מטפלת בכל סוגי הממצאים האורגניים שמקורם בחפירות ארכיאולוגיות, כגון אריגים, עורות, כלי עצם ועץ, ועוד. מפאת רגישותם של חומרים אלה לתנאי הסביבה, הם שורדים לרוב רק באזורים בעלי אקלים יבש. הטיפול כולל מיון, ניקוי ידני באמצעות מברשות, יישור אריגים, שימוש לפי הצורך בממיסים עדינים, בניית מארזים, תיעוד דיגיטלי והכנת הממצאים לתצוגה. עם תום הטיפול מועברים הממצאים למחסן מבוקר אקלים למניעת התדרדרות במצבם.